الهدف الرئيسي من المرحلة الثانية هو السماح في نهايتها بإنشاء مركز مرجعي في البيئة البحرية (CREM) في تونس. للقيام بذلك ، تم توسيع إطار الشراكة من أجل الارتباط مع المعاهد القائمة المتخصصة في العلوم البحرية (INSTM) ، في التحليل الدقيق للملوثات الكيميائية (INRAP و HSM) ولكن أيضًا في النمذجة (IPEIT). تم تجميع أنشطة LMI حول أربعة أهداف تهدف إلى فهم التفاعلات بين الملوثات والنظم البيئية البحرية بشكل أفضل ، مع اقتراح أدوات دعم القرار والمعالجة للمديرين من ناحية ، وبناء القدرات من ناحية أخرى بحيث يكون لدى المركز المرجعي المهارات اللازمة لضمان الرؤية الإقليمية والدولية.
وكما هو الحال في المرحلة الأولى ، فإن الأنشطة العلمية سوف يتم إنشاؤها بدعم من التمويل الخارجي (Blue-Med H2020 على وجه الخصوص) ، فتمويل المعهد سوف يكرس أساسا تدريبا جماعي (كتابة المشاريع ، والتثمين العلمي) ودعم المنابر ليتسنى تعبئتها للمشاريع الكبرى..
